Skip to main content
P
P
R
Pentatricopeptide Repeat Proteins
If you find this resource useful please cite the following:
Cheng S, Gutmann B, Zhong X, Ye Y, Fisher MF, Bai F, Castleden I, Song Y, Song B, Huang J, Liu X, Xu X, Lim BL, Bond CS, Yiu SM, Small I. (2016) “Redefining the structural motifs that determine RNA binding and RNA editing by pentatricopeptide repeat proteins in land plants.” Plant J. PMID: 26764122 doi: 10.1111/tpj.13121
Pentatricopeptide Repeat Proteins

PPR

Enter Protein Fragments e.g. VFTASKLISLYASVNKPKLSAKVFDSVHFKD, "Bead" Patterns e.g. P-P-P or E1-*DYW, PPR Types e.g. DYW or E+ etc. Or any text you like basically. See help at right

Found 104 Samples
Results for: All Species
Species
Number of Proteins
Actinidia chinensis (Kiwi) Taxon 3625
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» Ericales» Actinidiaceae» Actinidia»
808
(from 30 Assemblies)
Aegilops tauschii (Tausch's goatgrass) Taxon 37682
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» BOP clade» Pooideae» Triticodae» Triticeae» Triticinae» Aegilops»
608
(from 535 Assemblies)
Amborella trichopoda Taxon 13333
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» basal Magnoliophyta» Amborellales» Amborellaceae» Amborella»
840
(from 161 Assemblies)
Aquilegia coerulea (Rocky mountain columbine) Taxon 218851
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Ranunculales» Ranunculaceae» Thalictroideae» Aquilegia»
846
(from 101 Assemblies)
Arabidopsis lyrata (Lyre-leaved rock-cress) Taxon 59689
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Camelineae» Arabidopsis»
559
(from 14 Assemblies)
Arabidopsis thaliana (Mouse-ear cress) Taxon 3702
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Camelineae» Arabidopsis»
481
(from 5 Assemblies)
Archaeon loki Taxon 1538547
Archaea» Asgard group» Candidatus Lokiarchaeota» Lokiarchaeum»
1
(from 1 Assembly)
Aspergillus fumigatus Taxon 746128
Eukaryota» Fungi» Dikarya» Ascomycota» Pezizomycotina» Eurotiomycetes» Eurotiomycetidae» Eurotiales» Aspergillaceae» Aspergillus»
10
(from 5 Assemblies)
Bathycoccus prasinos Taxon 41875
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» prasinophytes» Mamiellophyceae» Mamiellales» Bathycoccaceae» Bathycoccus»
19
(from 14 Assemblies)
Beta vulgaris (Sugar beet) Taxon 161934
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» Caryophyllales» Chenopodiaceae» Betoideae» Beta»
521
(from 172 Assemblies)
Bigelowiella natans (Pedinomonas minutissima) Taxon 227086
Eukaryota» Rhizaria» Cercozoa» Chlorarachniophyceae» Bigelowiella»
99
(from 59 Assemblies)
Brachypodium distachyon (Purple false brome) Taxon 15368
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» BOP clade» Pooideae» Brachypodieae» Brachypodium»
492
(from 5 Assemblies)
Brassica napus (Rape) Taxon 3708
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Brassiceae» Brassica»
1139
(from 40 Assemblies)
Brassica oleracea (Wild cabbage) Taxon 3712
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Brassiceae» Brassica»
599
(from 267 Assemblies)
Brassica rapa (Field mustard) Taxon 3711
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Brassiceae» Brassica»
536
(from 23 Assemblies)
Caenorhabditis elegans Taxon 6239
Eukaryota» Metazoa» Ecdysozoa» Nematoda» Chromadorea» Rhabditida» Rhabditoidea» Rhabditidae» Peloderinae» Caenorhabditis»
3
(from 3 Assemblies)
Cajanus cajan (Pigeon pea) Taxon 3821
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Phaseoleae» Cajanus»
603
(from 234 Assemblies)
Capsella rubella (Pink shepherd's purse) Taxon 81985
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Camelineae» Capsella»
481
(from 13 Assemblies)
Capsicum annuum (Bell pepper) Taxon 4072
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Solanales» Solanaceae» Solanoideae» Capsiceae» Capsicum»
618
(from 373 Assemblies)
Carica papaya (Papaya) Taxon 3649
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Caricaceae» Carica»
521
(from 225 Assemblies)
Chlamydomonas reinhardtii Taxon 3055
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» Chlorophyceae» Chlamydomonadales» Chlamydomonadaceae» Chlamydomonas»
13
(from 10 Assemblies)
Chlorella NC64A (Green alga) Taxon 554065
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» Trebouxiophyceae» Chlorellales» Chlorellaceae» Chlorella»
26
(from 14 Assemblies)
Cicer arietinum (Chickpea) Taxon 3827
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Cicereae» Cicer»
767
(from 109 Assemblies)
Citrullus lanatus (Watermelon) Taxon 3654
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Cucurbitales» Cucurbitaceae» Benincaseae» Citrullus»
462
(from 12 Assemblies)
Citrus sinensis (Sweet orange) Taxon 2711
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Sapindales» Rutaceae» Aurantioideae» Citrus»
524
(from 10 Assemblies)
Coffea canephora (Robusta coffee) Taxon 49390
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Gentianales» Rubiaceae» Ixoroideae» Gardenieae complex» Bertiereae - Coffeeae clade» Coffeeae» Coffea»
541
(from 12 Assemblies)
Cucumis melo (Muskmelon) Taxon 3656
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Cucurbitales» Cucurbitaceae» Benincaseae» Cucumis»
459
(from 94 Assemblies)
Cucumis sativus (Cucumber) Taxon 3659
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Cucurbitales» Cucurbitaceae» Benincaseae» Cucumis»
479
(from 46 Assemblies)
Cyanidioschyzon merolae (Red alga) Taxon 45157
Eukaryota» Rhodophyta» Bangiophyceae» Cyanidiales» Cyanidiaceae» Cyanidioschyzon»
10
(from 9 Assemblies)
Cyanophora paradoxa Taxon 2762
Eukaryota» Glaucocystophyceae» Cyanophoraceae» Cyanophora»
32
Danio rerio (Zebrafish) Taxon 7955
Eukaryota» Metazoa» Chordata» Craniata» Vertebrata» Euteleostomi» Actinopterygii» Neopterygii» Teleostei» Ostariophysi» Cypriniformes» Cyprinidae» Danio»
7
(from 7 Assemblies)
Dictyostelium discoideum (Slime mold) Taxon 44689
Eukaryota» Amoebozoa» Mycetozoa» Dictyosteliida» Dictyostelium»
13
(from 5 Assemblies)
Drosophila melanogaster (Fruit fly) Taxon 7227
Eukaryota» Metazoa» Ecdysozoa» Arthropoda» Hexapoda» Insecta» Pterygota» Neoptera» Holometabola» Diptera» Brachycera» Muscomorpha» Ephydroidea» Drosophilidae» Drosophila» Sophophora»
4
(from 4 Assemblies)
Ectocarpus siliculosus (Brown alga) Taxon 2880
Eukaryota» Stramenopiles» PX clade» Phaeophyceae» Ectocarpales» Ectocarpaceae» Ectocarpus»
90
(from 68 Assemblies)
Elaeis guineensis (Oil palm) Taxon 51953
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Arecaceae» Arecoideae» Cocoseae» Elaeidinae» Elaeis»
722
(from 130 Assemblies)
Emiliania huxleyi Taxon 2903
Eukaryota» Haptophyceae» Isochrysidales» Noelaerhabdaceae» Emiliania»
71
(from 60 Assemblies)
Entamoeba histolytica Taxon 5759
Eukaryota» Amoebozoa» Archamoebae» Entamoebidae» Entamoeba»
2
(from 2 Assemblies)
Eucalyptus grandis (Flooded gum) Taxon 71139
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Myrtales» Myrtaceae» Myrtoideae» Eucalypteae» Eucalyptus»
670
(from 47 Assemblies)
Fragaria vesca (Woodland strawberry) Taxon 57918
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Rosales» Rosaceae» Rosoideae» Potentilleae» Fragariinae» Fragaria»
620
(from 139 Assemblies)
Gallus gallus (Chicken) Taxon 9031
Eukaryota» Metazoa» Chordata» Craniata» Vertebrata» Euteleostomi» Archelosauria» Archosauria» Dinosauria» Saurischia» Theropoda» Coelurosauria» Aves» Neognathae» Galloanserae» Galliformes» Phasianidae» Phasianinae» Gallus»
6
(from 6 Assemblies)
Glycine max (Soybean) Taxon 3847
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Phaseoleae» Glycine» Soja»
887
(from 24 Assemblies)
Gossypium arboreum (Tree cotton) Taxon 29729
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Malvales» Malvaceae» Malvoideae» Gossypium»
580
(from 28 Assemblies)
Gossypium raimondii (New World cotton) Taxon 29730
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Malvales» Malvaceae» Malvoideae» Gossypium»
585
(from 87 Assemblies)
Guillardia theta Taxon 55529
Eukaryota» Cryptophyta» Pyrenomonadales» Geminigeraceae» Guillardia»
44
(from 30 Assemblies)
Homo sapiens (Human) Taxon 9606
Eukaryota» Metazoa» Chordata» Craniata» Vertebrata» Euteleostomi» Mammalia» Eutheria» Euarchontoglires» Primates» Haplorrhini» Catarrhini» Hominidae» Homo»
6
(from 4 Assemblies)
Klebsormidium flaccidum (Filamentous green alga) Taxon 3175
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Klebsormidiophyceae» Klebsormidiales» Klebsormidiaceae» Klebsormidium»
64
Leishmania infantum Taxon 5671
Eukaryota» Euglenozoa» Kinetoplastida» Trypanosomatidae» Leishmaniinae» Leishmania»
28
(from 18 Assemblies)
Linum usitatissimum (Flax) Taxon 4006
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Malpighiales» Linaceae» Linum»
1016
(from 396 Assemblies)
Lotus japonicus Taxon 34305
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Loteae» Lotus»
541
(from 395 Assemblies)
Malus domestica (Apple) Taxon 3750
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Rosales» Rosaceae» Maloideae» Maleae» Malus»
1392
(from 1300 Assemblies)
Manihot esculenta (Cassava) Taxon 3983
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Malpighiales» Euphorbiaceae» Crotonoideae» Manihoteae» Manihot»
558
(from 322 Assemblies)
Medicago truncatula (Barrel medic) Taxon 3880
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Trifolieae» Medicago»
695
(from 219 Assemblies)
Micromonas pusilla (Picoplanktonic green alga) Taxon 38833
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» prasinophytes» Mamiellophyceae» Mamiellales» Mamiellaceae» Micromonas»
17
(from 11 Assemblies)
Mimulus guttatus (Yellow monkey flower) Taxon 4155
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Lamiales» Phrymaceae» Erythranthe»
587
(from 175 Assemblies)
Monosiga brevicollis (Choanoflagellate) Taxon 81824
Eukaryota» Choanoflagellida» Craspedida» Salpingoecidae» Monosiga»
5
(from 4 Assemblies)
Morus notabilis (Mulberry) Taxon 981085
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Rosales» Moraceae» Morus»
565
(from 347 Assemblies)
Mus musculus (Mouse) Taxon 10090
Eukaryota» Metazoa» Chordata» Craniata» Vertebrata» Euteleostomi» Mammalia» Eutheria» Euarchontoglires» Glires» Rodentia» Myomorpha» Muroidea» Muridae» Murinae» Mus» Mus»
8
(from 7 Assemblies)
Musa acuminata (Banana) Taxon 4641
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Zingiberales» Musaceae» Musa»
556
(from 12 Assemblies)
Naegleria gruberi (Amoeba) Taxon 5762
Eukaryota» Heterolobosea» Schizopyrenida» Vahlkampfiidae» Naegleria»
49
(from 29 Assemblies)
Nannochloropsis gaditana Taxon 72520
Eukaryota» Stramenopiles» Eustigmatophyceae» Eustigmatales» Monodopsidaceae» Nannochloropsis»
57
(from 48 Assemblies)
Nelumbo nucifera (Sacred lotus) Taxon 4432
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Proteales» Nelumbonaceae» Nelumbo»
739
(from 416 Assemblies)
Nicotiana sylvestris (Wood tobacco) Taxon 4096
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Solanales» Solanaceae» Nicotianoideae» Nicotianeae» Nicotiana»
552
(from 502 Assemblies)
Ostreococcus tauri Taxon 70448
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» prasinophytes» Mamiellophyceae» Mamiellales» Bathycoccaceae» Ostreococcus»
21
(from 12 Assemblies)
Panicum virgatum (Switchgrass) Taxon 38727
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» PACMAD clade» Panicoideae» Panicodae» Paniceae» Panicinae» Panicum»
1181
(from 1142 Assemblies)
Paramecium tetraurelia Taxon 5888
Eukaryota» Alveolata» Ciliophora» Intramacronucleata» Oligohymenophorea» Peniculida» Parameciidae» Paramecium»
5
(from 4 Assemblies)
Perkinsus marinus Taxon 31276
Eukaryota» Alveolata» Perkinsea» Perkinsida» Perkinsidae» Perkinsus»
15
(from 13 Assemblies)
Phaeodactylum tricornutum (Diatom) Taxon 2850
Eukaryota» Stramenopiles» Bacillariophyta» Bacillariophyceae» Bacillariophycidae» Naviculales» Phaeodactylaceae» Phaeodactylum»
50
(from 26 Assemblies)
Phaseolus vulgaris (Kidney bean) Taxon 3885
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Fabales» Fabaceae» Papilionoideae» Phaseoleae» Phaseolus»
510
(from 13 Assemblies)
Phoenix dactylifera (Date palm) Taxon 42345
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Arecaceae» Coryphoideae» Phoeniceae» Phoenix»
893
(from 365 Assemblies)
Physcomitrella patens (Moss) Taxon 3218
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Bryophyta» Bryophytina» Bryopsida» Funariidae» Funariales» Funariaceae» Physcomitrella»
113
(from 91 Assemblies)
Phytophthora infestans (Potato late blight fungus) Taxon 4787
Eukaryota» Stramenopiles» Oomycetes» Peronosporales» Phytophthora»
31
(from 16 Assemblies)
Picea abies (Norway spruce) Taxon 3329
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Pinidae» Pinales» Pinaceae» Picea»
1448
(from 1352 Assemblies)
Plasmodium falciparum Taxon 5833
Eukaryota» Alveolata» Apicomplexa» Aconoidasida» Haemosporida» Plasmodiidae» Plasmodium» Plasmodium (Laverania)»
2
(from 2 Assemblies)
Populus euphratica (Euphrates poplar) Taxon 75702
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Malpighiales» Salicaceae» Saliceae» Populus»
624
(from 293 Assemblies)
Populus trichocarpa (Western balsam poplar) Taxon 3694
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Malpighiales» Salicaceae» Saliceae» Populus»
618
(from 32 Assemblies)
Porphyridium purpureum (Red alga) Taxon 35688
Eukaryota» Rhodophyta» Bangiophyceae» Porphyridiales» Porphyridiaceae» Porphyridium»
47
Prunus mume (Japanese apricot) Taxon 102107
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Rosales» Rosaceae» Maloideae» Amygdaleae» Prunus»
641
(from 40 Assemblies)
Prunus persica (Peach) Taxon 3760
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Rosales» Rosaceae» Maloideae» Amygdaleae» Prunus»
580
(from 12 Assemblies)
Reticulomyxa filosa Taxon 46433
Eukaryota» Rhizaria» Foraminifera» Monothalamids» Reticulomyxidae» Reticulomyxa»
64
(from 64 Assemblies)
Ricinus communis (Castor bean) Taxon 3988
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» fabids» Malpighiales» Euphorbiaceae» Acalyphoideae» Acalypheae» Ricinus»
522
(from 230 Assemblies)
Saccharomyces cerevisiae (Baker's yeast) Taxon 4932
Eukaryota» Fungi» Dikarya» Ascomycota» Saccharomycotina» Saccharomycetes» Saccharomycetales» Saccharomycetaceae» Saccharomyces»
5
(from 5 Assemblies)
Selaginella moellendorffii (Spikemoss) Taxon 88036
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Lycopodiopsida» Selaginellales» Selaginellaceae» Selaginella»
3949
(from 225 Assemblies)
Sesamum indicum (Oriental sesame) Taxon 4182
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Lamiales» Pedaliaceae» Sesamum»
487
(from 35 Assemblies)
Setaria italica (Foxtail millet) Taxon 4555
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» PACMAD clade» Panicoideae» Panicodae» Paniceae» Cenchrinae» Setaria»
549
(from 9 Assemblies)
Solanum lycopersicum (Tomato) Taxon 4081
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Solanales» Solanaceae» Solanoideae» Solaneae» Solanum» Lycopersicon»
497
(from 13 Assemblies)
Solanum tuberosum (Potato) Taxon 4113
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Solanales» Solanaceae» Solanoideae» Solaneae» Solanum»
522
(from 249 Assemblies)
Sorghum bicolor (Sorghum) Taxon 4558
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» PACMAD clade» Panicoideae» Andropogonodae» Andropogoneae» Sorghinae» Sorghum»
501
(from 13 Assemblies)
Spirodela polyrhiza (Giant duckweed) Taxon 29656
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Araceae» Lemnoideae» Spirodela»
559
(from 32 Assemblies)
Symbiodinium minutum Taxon 1202447
Eukaryota» Alveolata» Dinophyceae» Suessiales» Symbiodiniaceae» Symbiodinium»
687
(from 557 Assemblies)
Tarenaya hassleriana (spider flower) Taxon 28532
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Cleomaceae» Tarenaya»
626
(from 89 Assemblies)
Thalassiosira pseudonana (Marine diatom) Taxon 35128
Eukaryota» Stramenopiles» Bacillariophyta» Coscinodiscophyceae» Thalassiosirophycidae» Thalassiosirales» Thalassiosiraceae» Thalassiosira»
38
(from 16 Assemblies)
Theileria annulata Taxon 5874
Eukaryota» Alveolata» Apicomplexa» Aconoidasida» Piroplasmida» Theileriidae» Theileria»
3
(from 3 Assemblies)
Thellungiella parvula Taxon 98039
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Brassicaceae incertae sedis» Schrenkiella»
454
(from 38 Assemblies)
Thellungiella salsuginea (Saltwater cress) Taxon 72664
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Brassicales» Brassicaceae» Eutremeae» Eutrema»
501
(from 147 Assemblies)
Theobroma cacao (Cacao) Taxon 3641
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» malvids» Malvales» Malvaceae» Byttnerioideae» Theobroma»
534
(from 11 Assemblies)
Trichomonas vaginalis Taxon 5722
Eukaryota» Parabasalia» Trichomonadida» Trichomonadidae» Trichomonas»
4
(from 3 Assemblies)
Triticum aestivum (Wheat) Taxon 4565
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» BOP clade» Pooideae» Triticodae» Triticeae» Triticinae» Triticum»
1646
(from 1587 Assemblies)
Triticum urartu (Red wild einkorn) Taxon 4572
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» BOP clade» Pooideae» Triticodae» Triticeae» Triticinae» Triticum»
481
(from 438 Assemblies)
Trypanosoma brucei Taxon 5691
Eukaryota» Euglenozoa» Kinetoplastida» Trypanosomatidae» Trypanosoma»
28
(from 11 Assemblies)
Utricularia gibba (Two-flower bladderwort) Taxon 13748
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» asterids» lamiids» Lamiales» Lentibulariaceae» Utricularia»
399
(from 286 Assemblies)
Vitis vinifera (Grape) Taxon 29760
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» eudicotyledons» Gunneridae» Pentapetalae» rosids» Vitales» Vitaceae» Vitis»
632
(from 25 Assemblies)
Volvox carteri (Green alga) Taxon 3067
Eukaryota» Viridiplantae» Chlorophyta» Chlorophyceae» Chlamydomonadales» Volvocaceae» Volvox»
11
(from 9 Assemblies)
Xenopus tropicalis (Western clawed frog) Taxon 8364
Eukaryota» Metazoa» Chordata» Craniata» Vertebrata» Euteleostomi» Amphibia» Batrachia» Anura» Pipoidea» Pipidae» Xenopodinae» Xenopus» Silurana»
8
(from 7 Assemblies)
Zea mays (Maize) Taxon 4577
Eukaryota» Viridiplantae» Streptophyta» Embryophyta» Tracheophyta» Spermatophyta» Magnoliophyta» Liliopsida» Poales» Poaceae» PACMAD clade» Panicoideae» Andropogonodae» Andropogoneae» Tripsacinae» Zea»
661
(from 10 Assemblies)